collocou-se ao lado do Governador General José Clarindo de de Queiroz a quem acompanhou ao Rio de Janeiro após o movimento levado a effeito a 17 de Fevereiro de 1892.
Um mez depois que chegou á Capital Federal, publicou pelas columnas do Combate um manifesto politico dando conta dos successos de que acabava de ser testemunha o Ceará.
Continuou a collaborar nessa folha publicando artigos de propaganda francamente de combate contra o governo do Marechal Floriano, sendo o ultimo delles publicado no dia 10 de Abril de 1892, estando o seu nome na lista dos que deveriam ser presos e desterrados, acto que, todavia, não foi levado a effeito.
Esses artigos e o « Manifesto » foram colleccionados pela redacção do Correio do Cariry, que os reimprimiu sob o titulo Senador Padre Fernandes e Escriptos Políticos, e os distribuiu largamente.
Precedia-os uma encomiástica apresentação, devida á hábil penna do Dr. J. B. de Siqueira Cavalcante.
Ainda em Abril de 1892 foi nomeado vigário de Cachoeira de Itapemirim, do então bispado do Rio de Janeiro, no Estado do Espirito Santo.
Exerceu essa commissão até Junho do anno seguinte, quando foi transferido para a importante parochia de Vassouras, no Estado do Rio, logar que deixou a pedido seis mezes mais tarde, indo residir temporariamente em Juiz de Fóra, no Estado de Minas Geraes.
Em 1894 acompanhou D. José Lourenço da Costa Aguiar, 1.º Bispo do Amazonas, e de quem foi o braço direito na organisação da nova diocese, sendo nomeado Conego da Cathedral de Manáos a 8 de Dezembro desse anno.
Acompanhou-o ainda na qualidade de Secretario particular em differentes visitas nos rios Solimões, Purús, Madeira, Negro, etc., fazendo das suas viagens minuciosas descripções, que publicou a um só tempo em fórma de correspondências na Verdade, e Apostolo, jornaes catholicos vindos
a lume em Fortaleza e no Rio de Janeiro.
